廢棄物管理政策與源頭減量
本校透過源頭減量與制度管理強化廢棄物管理：設置化學品交流平台促進資源共享、定期盤點協助回收老舊鋼瓶，並於2025年訂定化學品及鋼瓶運作管理規範；同時推動生物廢棄物減量，兩校區感染性廢棄物每月產出量均控制於20公斤內。
各類廢棄物循環回收流程
每日由各單位垃圾放置區清運至回收場集中存放，委由合格廠商辦理清運。
涵蓋實驗室廢液、實驗室化學品及生物醫療廢棄物三類，經分類暫存後，委託合格清除處理廠商辦理清運，並運送至成功大學環境資源研究管理中心資源回收廠處理。
各單位設置資源回收區，由校內清潔人員協助分類與收集後，統一送至資源回收場集中存放，委由合格廠商辦理清運及回收處理，並每月申報重量資料。
由本校餐廳及資收場進行回收作業並定期清運處理；因應非洲豬瘟防疫規範，改由合格廠商清運至臺南市鹽水掩埋場進行掩埋處理。
資源回收與減塑實踐
本校設有「減少使用免洗餐具及包裝飲用水」網頁宣導及填報專區，學生餐廳自備環保餐具享減價措施，行政單位亦備有環保餐盒可供借用；2025年並完成全校資源回收桶設施意象更新，資源回收場設有紙容器清洗水槽，回收申報成效近年多次獲獎肯定。
2022年臺南市資源回收申報獎
2023年臺南市資源回收申報獎
2022年惜用顧地球評比學校組優等
完整有害及一般事業廢棄物分類明細，詳見《2025年永續報告書》第5-5節。